داکسی سایکلین متعلق به گروه تتراسایکلین است و علیه بسیاری از باکتری‌های گرم مثبت و گران‌منفی مانند بوردتلا، کامپیلوباکتر، اشریشیا کلی، هموفیلوس، پاستورلا، سالمونلا، استافیلوکوکوس و استرپتوکوک، باکتریواستاتیک عمل می‌کند. داکسی سایکلین همچنین علیه کلامیدیا، مایکوپلاسما و ریکتزیا نیز فعال است. عملکرد داکسی سایکلین بر اساس مهار سنتز پروتئین باکتریایی است. داکسی سایکلین میل ترکیبی زیادی با ریه‌ها دارد و بنابراین به ویژه برای درمان عفونت‌های تنفسی باکتریایی مفید است.