داکسی سایکلین متعلق به گروه تتراسایکلین‌ها است و در برابر بسیاری از باکتری‌های گرم مثبت و گرم منفی مانند بوردتلا، کامپیلوباکتر، ای. کولی، هموفیلوس، پاستورلا، سالمونلا، استافیلوکوکوس و استرپتوکوک، اثر باکتریواستاتیک دارد. داکسی سایکلین همچنین در برابر کلامیدیا، مایکوپلاسما و گونه‌های ریکتزیا فعال است. عملکرد داکسی سایکلین بر اساس مهار سنتز پروتئین باکتریایی است. داکسی سایکلین میل ترکیبی زیادی با ریه‌ها دارد و بنابراین به ویژه برای درمان عفونت‌های تنفسی باکتریایی مفید است.